海报中我们看到被认为是已故的FBI警探“赤井秀一”的迷之男子，以及柯南和中枪的世良真纯。而真纯的台词说着：是他……吗？此前的预告片中狙击枪瞄准镜、某高塔的剪影等画面都和本次的海报相互呼应，看来这次剧场版终于要进主线了！剧情是否也能像TV版中“红与黑的对决”一样饱满刺激呢？让我们拭目以待！

南宋末年，小白为救许仙水漫金山，终被法海压在雷峰塔下。小青则意外被法海打入诡异的修罗城幻境。几次危机中小青被神秘蒙面少年所救，小青带着出去救出小白的执念历经劫难与成长，同蒙面少年一起寻找离开的办法。

经过鳌拜一事后，康熙深知官员腐败，决定派王二狗三人作为钦差下江南查访民情。在荣城绿叶村，王小宝因丧尸与公孙不二、展犬走失，王小宝身无分文沦落飘香楼，被包姐骂人神功震撼的他偷偷学艺。同时他发现飘香楼头牌柔柔身负冤情，决定帮柔柔一家申冤。不二和狗子这时也与小宝重逢，三人协作查明了绿叶村丧尸事件和柔柔一家的冤案，暗中黑手知县和师爷也得到了自己应有的惩罚。在小宝沦落飘香楼期间，柔柔和小宝二人日久生情，小宝抱得美人归。